邓琛

生物工程专业：硕士生导师

生物与医药专业（生物工程领域）：硕士生导师

 邓琛，副教授，工学博士，生物反应器工程国家重点实验室固定成员。研究领域代谢工程、合成生物学、酶学与酶工程、发酵工程等。通过转运途径改造、模块化代谢工程策略和动态基因调控等策略对代谢网络进行系统改造，构建了系列功能糖及生物基单体的微生物合成细胞工厂，高效合成化学品、蛋白质、生物材料及酶制剂。在相关领域以第一作者或通讯身份在Nucleic Acids Research、Green Chemistry、Metabolic Engineering等国际权威期刊上发表学术论文10余篇，获授权专利10余件，部分成果正在相关企业实施产业化。入选上海市“晨光”计划和上海市“超级博士后”激励计划。主持国家自然科学基金青年科学基金项目，国家重点研发计划重点专项子课题等多个项目或基金，获上海市科技进步一等奖（9/12）、全国农牧渔业丰收奖（成果奖）二等奖（6/25）。

研究方向

1. 功能碳水化合物的绿色生物合成

2. 生物基材料化学品的绿色生物合成

3. 光控动态调控基因回路的设计与构建

4. 人工智能赋能蛋白定向优化

5. 谷氨酸棒杆菌、假单胞菌的基因编辑及调控工具开发

代表性论文

[1] Chen Deng, Ruijie Xin, Xingjian Li, Jie Zhang, Liqiang Fan, Yongjun Qiu, Liming Zhao*.Optogenetic control of Corynebacterium glutamicumgene expression. Nucleic Acids Research. 2024.11

[2] Jie Zhang, Yanan Cui, Peiyi Zhang, Mengqi Zhao, Liqiang Fan, Xu Li, Chen Deng*, Liming Zhao*. Enhanced heparosan biosynthesis in Corynebacterium glutamicum by systematic metabolic engineering and translation-level fine-tuning. Bioresources and Bioprocessing. 2026.01

[3] Yanan Cui, Peiyi Zhang, Renjie Miao, Mengqi Zhao, Liqiang Fan, Xu Li, Yongjun Qiu, Chen Deng*, Liming Zhao*. Multi-dimensional metabolic engineering and enzyme engineering in Escherichia coli for highly efficient biosynthesis of 2,5-furandicarboxylic acid. Bioresource Technology. 2026.02

[4] Yanan Cui, Jie Zhang, Xijun Xing, Hanwen Zhang, Yutong Chen, Liqiang Fan, Xu Li, Yongjun Qiu, Chen Deng*, Liming Zhao*. Novel iterative genome mining and engineering of a bifunctional KvVDH enable selective production of furan carboxylic acids from high-concentration 5-hydroxymethylfurfural. Green Chemistry. 2026.06

[5] Qiong Zhao, Liqiang Fan, Yanan Cui, Mengxuan Zhao, Chen Deng*, Liming Zhao*. Isolation and identification of a novel Chitinilyticum sp.C8: Unleashing the potential for chitin oligosaccharides production. Journal of Agricultural and Food Chemistry. 2025.09

[6] Chen Deng, Ruijie Xin, Xingjian Li, Liqiang Fan, Yongjun Qiu, Liming Zhao*. Corynebacterium glutamicum for microbial production of chitin oligosaccharides using modular engineering. Food Bioengineering. 2025.03

[7] Jinqi Shi, Chen Deng, Chunyue Zhang, Shu Quan, Liqiang Fan*, Liming Zhao*. Combinatorial metabolic engineering of Escherichia coli for de novo production of structurally defined and homogeneous Amino oligosaccharides. Synthetic and Systems Biotechnology. 2024.07

[8] Yanan Cui^#, Chen Deng^#, Liqiang Fan, Yongjun Qiu, Liming Zhao*, Progress in the biosynthesis of bio-based PET and PEF polyester monomers. Green Chemistry. 2023.10

[9]Chen Deng, Mengxuan Zhao, Qiong Zhao, Liming Zhao*， Advances in green bioproduction of marine and glycosaminoglycan oligosaccharides. Carbohydrate Polymers. 2023.03

[10]Chunyu Ma, Chunyue Zhang, Liqiang Fan, Chen Deng*, Liming Zhao*,De novo 2′-fucosyllactose bioproduction through modular engineering of a novel Escherichia coliK12-derived strain. Food Bioengineering.2023.09

[11]Chen Deng, Yaokang Wu, Xueqin Lv, Jianghua Li, Yanfeng Liu, Guocheng Du, Jian Chen, Long Liu*. Refactoring transcription factors for metabolic engineering. Biotechnology Advances. 2022.08

[12] Chen Deng, Xueqin Lv, Jianghua Li, Hongzhi Zhang, Yanfeng Liu, Guocheng Du, Rodrigo Ledesma Amaro, Long Liu*. Synergistic improvement of N-acetylglucosamine production by engineering transcription factors and balancing redox cofactors. Metabolic Engineering. 2021.07

[13] Jiangong Lu, Yaokang Wu, Chen Deng, Yanfeng Liu, Xueqin Lv, Jianghua Li, Guocheng Du, Long Liu*, Model-based dynamic engineering of Escherichia colifor N-acetylglucosamine overproduction. Biotechnol Notes. 2022.02

[14] Meng Chai, Chen Deng, Qi Chen, Wei Lu, Yanfeng Liu, Jianghua Li, Guocheng Du, Xueqin Lv, Long Liu*. Synthetic Biology Toolkits and Metabolic Engineering Applied in Corynebacterium glutamicum for Biomanufacturing. ACS Synthetic Biology. 2021.12

[15] Qiong Zhao, Liqiang Fan, Chen Deng, Chunyu Ma, Chunyue Zhang*, Liming Zhao*, Bioconversion of chitin into chitin oligosaccharides using a novel chitinase with high chitin-binding capacity. International journal of biological macromolecules. 2023.06

[16] Jinqi Shi, Chen Deng, Chunyue Zhang, Shu Quan, Liqiang Fan*, Liming Zhao*, Combinatorial metabolic engineering of Escherichia colifor de novo production of structurally defined and homogeneous Amino oligosaccharides.Synthetic and Systems Biotechnology. 2024.05

[17] Chen Deng, Xueqin Lv, Jianghua Li, Hongzhi Zhang, Yanfeng Liu, Guocheng Du, Rodrigo Ledesma Amaro, Long Liu*. Synergistic improvement of N-acetylglucosamine production by engineering transcription factors and balancing redox cofactors. Metabolic Engineering. 2021.07

[18]Chen Deng, Xueqin Lv, Jianghua Li, Yanfeng Liu, Guocheng Du, Long Liu*. Development of a DNA double-strand break-free base editing tool in Corynebacterium glutamicum for genome editing and metabolic engineering.Metabolic Engineering Communications. 2020.12

[19]Chen Deng, Xueqin Lv, Yanfeng Liu, Jianghua Li, Wei Lu, Guocheng Du, Long Liu*. Metabolic engineering of Corynebacterium glutamicum S9114 based on whole-genome sequencing for efficient N-acetylglucosamine synthesis. Synthetic and Systems Biotechnology. 2019.06

[20]Chen Deng, Xueqin Lv, Jianghua Li, Yanfeng Liu, Guocheng Du, Rodrigo Ledesma Amaro, Long Liu*. Synthetic repetitive extragenic palindromic (REP) sequence as an efficient mRNA stabilizer for protein production and metabolic engineering in prokaryotic cells. Biotechnology and Bioengineering. 2019.01 (封面文章)

[21] Chen Deng, Jianghua Li, Hyun-Dong Shin, Guocheng Du, Jian Chen, Long Liu*. Efficient expression of cyclodextrin glycosyltransferase from Geobacillus stearothermophilus in Escherichia coli by promoter engineering and downstream box evolution. Journal of Biotechnology.2018.01

专利

[1]一种香草醛脱氢酶突变体及其生物转化高浓度 5 - 羟甲基糠醛合成呋喃羧酸的方法 | 中国 | CN1197062096A | 2026.06.01 | 赵黎明，邓琛，章颖，李张曦，唐婧怡，幸锡骏，姬蕊欣，崔亚楠

[2] 一种基于人工智能的壳聚糖酶定向优化方法 | 中国 | CN119624812A | 2026.04.18 | 赵黎明，邓琛，赵梦琪

[3] 一种生产对苯二甲酸重组大肠杆菌及其应用 | 中国 | CN119495031A | 2025.07.15 | 赵黎明，邓琛，毛晓灿，金佳杨

[4] RamA Transcription Factor Mutant for Promoting Production Of N-Acetylglucosamine and Use Thereof | 美国 | US 12,275,763 B2 | 2025.04.15 | Long Liu, Jian Chen, Xueqin Lv, Jianxing Lu, Changfeng Liu, Guocheng Du, Jianghua Li, Chen Deng, Jiangong Lu

[5] 一种蓝光响应的谷氨酸棒杆菌工程菌株及其构建方法与应用 | 中国 | CN119391616A | 2025.02.07 | 赵黎明，邓琛，辛瑞杰，李行健，张婕

[6] 一种用于生产硫酸软骨素的重组谷氨酸棒杆菌及其构建方法与应用 | 中国 | CN119391617A | 2025.02.07 | 赵黎明，邓琛，李行健

[7] 一种生产几丁寡糖的重组谷氨酸棒杆菌及构建方法与应用 | 中国 | CN118638704A | 2024.09.13 | 赵黎明，邓琛，辛瑞杰，崔亚楠

[8] 提高 N - 乙酰氨基葡萄糖产量的 RamAM 转录因子突变体 | 中国 | CN112707955A | 2022.01.18 | 刘龙，陈坚，吕雪芹，邓琛，卢健行，堵国成，李江华，刘长峰，卢建功

[9] 一种蛋白质因子 RRF 编码基因及其在 N - 乙酰氨基葡萄糖生产中的应用 | 中国 | CN110964685A | 2022.01.18 | 刘龙，邓琛，卢健行，刘长峰，卢建功，李江华，堵国成，陈坚

[10] 一种生产 N - 乙酰氨基葡萄糖的谷氨酸棒杆菌及其应用 | 中国 | CN108424870A | 2021.07.27 | 刘龙，堵国成，陈坚，李江华，邓琛

[11] 一种高产乙酰氨基葡萄糖的重组谷氨酸棒杆菌及其应用 | 中国 | CN110195036B | 2021.06.25 | 刘龙，邓琛，卢健行，刘长峰，卢建功，李江华，堵国成，陈坚

[12] 一种高产乙酰氨基葡萄糖重组谷氨酸棒杆菌及其应用 | 中国 | CN110195036A | 2021.06.25 | 刘龙，邓琛，卢健行，刘长峰，卢建功，李江华，堵国成，陈坚

[13] 一种促进 N - 乙酰氨基葡萄糖生产的蛋白质起始因子 IF3 突变体及其应用 | 中国 | CN110964090B | 2021.02.19 | 刘龙，邓琛，卢健行，刘长峰，卢建功，李江华，堵国成，陈坚

[14] 一种促进 N - 乙酰氨基葡萄糖生产的 RamA 转录因子突变体及其应用 | 中国 | CN110885364B | 2021.02.02 | 刘龙，邓琛，卢健行，刘长峰，卢建功，李江华，堵国成，陈坚

[15] 一种提高外源基因 mRNA 数量的 DNA 及其应用 | 中国 | CN108531496A | 2020.11.06 | 刘龙，堵国成，陈坚，李江华，邓琛

[16] 一种提高蛋白分泌效率的信号肽突变体及其应用 | 中国 | CN107022005A | 2020.02.14 | 堵国成，刘龙，陈坚，李江华，邓琛

[17] 一种提高蛋白分泌效率的 pelB 信号肽突变体及其应用 | 中国 | CN107082801A | 2019.12.24 | 堵国成，刘龙，陈坚，李江华，邓琛

主要承担科研项目

2024年上海市“科技创新行动计划”合成生物学领域项目

2023年上海市“晨光计划”

2023年国家自然科学基金青年项目

2022年国家重点研发计划重点专项子课题

2022年上海市基础研究特区项目

中国博士后科学基金第71批面上资助

华理-京博应用技术联合研究院探索课题

学术荣誉

2023年度上海市“晨光学者”

2022年度上海市“超级博士后”

国内外学术兼职

《Food Bioengineering》期刊编辑

《Frontiers in Bioscience-Landmark》期刊编委

教学工作

研究生专业核心课，《微生物生理及代谢调控》，16/32学时，2学分

本科生专业核心课，《食品合成生物学》，40/40学时，2.5学分

诚挚欢迎对生物催化、功能糖及生物基材料研发、代谢工程、合成生物学等领域有浓厚兴趣的本科生、硕士生加入本课题组。期待与你一同探索学术前沿，推动科研创新，共同书写科研新篇章！

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